植物DNA条形码2.0与系统发育基因组学研讨

及技术交流会（III）

（第二轮通知）

基于DNA序列信息的物种鉴定和系统发育研究是当今生命科学和生物技术领域的一个前沿热点方向。随着测序技术的飞速发展，该领域的工作已进入到基因组学时代。自2003年DNA条形码的提出和随后国际相关研究计划的实施，中国科学院于2009年和2017年先后启动了依托中国西南野生生物种质资源库的“植物DNA条形码研究”和“植物DNA条形码2.0与系统发育基因组学研究”开放研究项目。依托项目，昆明植物所于2020年12月和2021年7月在云南昆明成功举办了两期“植物DNA条形码2.0与系统发育基因组学”研讨培训班，为该领域的研究和应用提供了一个良好的交流实践平台，受到广泛关注和欢迎。

测序成本快速降低和生物信息技术的不断提高，大规模使用低\单拷贝核基因数据已成为可能，这为研究植物物种快速辐射进化和杂交起源等带来了新希望。经研究，定于2022年8月14日-18日在昆明举办以DGS （Deep Genome Skimming）为核心技术的“植物DNA条形码2.0与系统发育基因组学研讨及技术交流会”。欢迎国内相关领域的专家、青年研究人员踊跃参加。

一、组织机构

主办：中国科学院昆明植物研究所

云南省植物学会

承办：中国西南野生生物种质资源库

国家重要野生植物种质资源库

全国科学院联盟生物多样性分会    

协办：云南吴征镒科学基金会

二、会议时间和地点

时间：2022年8月14日-18日

地点：中国科学院昆明植物研究所，行政楼三楼学术报告厅

报到时间：

8月14日15:00-18:00（所外代表，晟世仟和酒店大堂）

8月15日08:00-09:00（本所代表，昆明植物所学术报告厅）

三、会议日程

8月14日  会议报到

8月15日  会议报告

8月16日  数据分析技术交流

8月17日  野外实践交流

8月18日  二代测序文库构建实践交流

（注：详见附件会议日程）

四、注册缴费

1. 参会代表唯一注册网址：http://GBOWS2022.scimeeting.cn

 

2. 注册截止时间：2022年8月10日17:00

3. 会议注册费：3000.00元/人

4. 缴费方式

（1）线上缴费：通过会议网站注册报名，进行线上支付。

（2）汇款缴费：通过会议网站注册后，汇款至以下账户，并将汇款凭证上传至会议网站。

开户名：云南省植物学会

开户行：交通银行云南省分行营业部

账  号：5310 0010 0010 3300 00133

汇款请备注：DNA+姓名。如多人同时缴费，需列上全部姓名。

5. 会议用餐统一安排，交通和住宿费用自理。

6. 注册费一经缴纳，不再退款，可转给同单位的参会代表。

五、住宿推荐

昆明晟世仟和酒店（昆明市盘龙区沣源路和小康大道路口）

会议协议价：380元/天（标准间、单间）

     注：预定请联系会务组黄艺伟18654676616。

六、交通指南

1. 昆明长水机场至酒店

出租车：行驶里程数约33公里，全程约40分钟，费用约150元。

地铁+公交：机场中心乘坐地铁6号线（塘子巷方向）到达塘子巷站，换乘2号线（北部汽车站方向）到达龙头街站，换乘96路公交（永昌小区方向）到达实力郡城（小康大道）站下车步行约200米到达晟世仟和酒店。

2. 昆明火车站至酒店

出租车：行驶里程数约20公里，全程约40分钟，费用约52元。

地铁+公交：昆明火车站搭乘地铁1号线、2号线（北部汽车站方向）到达龙头街站，换乘96路公交（永昌小区方向）到达实力郡城（小康大道）站下车步行约200米到达晟世仟和酒店。

公交：昆明站（北京路）乘坐23路公交车（北部公交枢纽站方向）至北辰大道路口站，换乘96路公交车（北部公交枢纽站方向）到达实力郡城（小康大道）站下车步行约200米到达晟世仟和酒店。

3. 昆明南站至酒店

地铁+公交：昆明南站搭乘地铁1号线（往北部汽车站方向）到达龙头街站，换乘96路公交（永昌小区方向）到达实力郡城（小康大道）站下车步行约200米到达晟世仟和酒店。

4. 酒店到昆明植物所

会务组安排大巴车负责酒店与昆明植物所之间的往返交通。

七、疫情防控

由于疫情原因，本次会议不接受来自中高风险地区的代表报名参会。会议期间需严格遵守昆明市和昆明植物所的疫情防控工作要求。

参会代表可根据微信小程序“国务院客户端——各地疫情防控政策措施”查询相关信息。

八、会务联系

会务咨询：黄艺伟 18654676616  huangyiwei@mail.kib.ac.cn

注册缴费：杨云珊 13888179794  ysyang@mail.kib.ac.cn

附件：会议日程

中国科学院昆明植物研究所

云南省植物学会

2022年8月1日

会议报告日程

时间：2022年8月15日09:00-17:10   地点：昆明植物所行政楼三楼学术报告厅

数据分析技术交流日程

时间：2022年8月16日09:00-17:30

地点：昆明植物所行政楼三楼学术报告厅

一、培训目的

针对生物信息学基础较弱、对植物系统发育学和物种鉴定领域感兴趣的研究生和科研人员，通过培训能快速准确地了解和掌握利用低成本DGS数据获取叶绿基因组、核糖体DNA片段、单/低拷贝直系同源核基因片段等用以系统发育重建、物种鉴定等数据分析和处理能力。

二、培训目标

本次培训讲座和案例分析演示相结合，让学员们逐步了解、掌握全基因组浅层测序数据的组装、多样品单拷贝直系同源核基因片段的获取、序列比对和评估、系统发育重建、物种鉴定等操作。

三、培训内容安排

1. DNA二代测序技术进展

2. GetOrganelle软件介绍、细胞基因和核糖体DNA序列组装

3. 从DGS数据获取核基因序列方法介绍和案例分析演示

4. 目标序列评估、筛选和矩阵比对

5. 系统发育重建和物种鉴定分析

四、培训团队

郁文彬，中国科学院西双版纳热带植物园，研究员

贺正山，中国科学院昆明植物研究所，工程师

姚  昕，中国科学院西双版纳热带植物园，助理研究员

莫智琼，中国科学院昆明植物研究所，博士研究生

五、注意事项

1. 参加人员需自带笔记本电脑，了解Linux 或 MacOS常用操作命令；

2. 从事过DNA序列处理、比对和分析；

3. 了解高通量测序数据和de novo组装。

野外实践交流日程

时间：2022年8月17日 08:30-17：00

08:30                      集合乘车

09:00-09:30           DNA材料采集技术规范指导

09:30-17:00           野外采集分组实践

地点：昆明植物所1号门停车场集合，前往昆明近郊

一、实践目的

通过野外实操，掌握野外采集DNA材料、标本压制、图像拍摄、数据填写等技术和规范的要点。

二、工作目标

完成10号（每人单独完成1-2号）DNA单元的采集。

三、分组安排

组织协调：张  挺

A组领队：张  挺 13577059606

B组领队：刘  成 15925149233

C组领队：郭永杰 13987126536

D组领队：亚吉东 15925229625

四、注意事项

1. 参加人员须带相机、GPS；

2. 自备适合野外工作的衣物、鞋袜和防雨防晒用具等；

3. 自备个性化药物；培训过程中，身体若有不适反应请及时告知会务人员；

4. 野外实践海拔约2000-2500米，处于云贵高原，请注意预防高原反应。

二代测序文库构建实践日程

时间：2022年8月18日 09:00-17:30

地点：昆明植物所中国西南野生生物种质资源库301实验室

一、实践目的

通过实验操作，掌握二代测序文库制备、质控的基本方法及操作技巧。

二、工作目标

每组完成2-4个标准DNA样品的二代测序文库制备、质控。

三、分组安排

组织协调：杨  静

A组领队：林春艳

B组领队：张金萍

C组领队：杨志云

D组领队：杨继雄

四、注意事项

1. 参加人员严格遵守实验室的规章制度，不私自动用仪器及实验用品；

2. 实验操作时穿着实验服，佩戴实验手套；

3. 培训过程中，如遇身体不适请及时告知会务人员。

 

 

 

 

中国科学院昆明植物研究所

云南省植物学会

                                   2022年8月1日

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